FIFA Manager 07 plaatst je in de schoenen van een voetbalcoach. Je zult zowel op het kantoor, in de dugout en op het veld actief zijn. In het kantoor zul je je bezig houden met concurrerende coaches. In de dugout moet je je team naar een nieuw niveau tillen met het vernieuwde transfersysteem. Ook zul je samenwerkingsverbanden moeten vormen met andere teams om spelers en andere middelen te delen. Uiteraard ben je ook verantwoordelijk voor je vier jeugdelftallen. Op het veld bepaal jij de tactiek en de wissels.
FIFA Manager 07 laat je niet alleen coachen, het is namelijk ook mogelijk om zelf een speler te trainen en zelfs met hem mee te doen aan een wedstrijd. Deze wedstrijden worden met driedimensionale graphics weergegeven. Met de editor in deze game is het mogelijk om zelf spelers en clubs te maken en ze vervolgens via het internet uit te wisselen met anderen.