Populous: The Beginning is het derde deel in de Populous-serie, oorspronkelijk gecreëerd door Peter Molyneux. Dit is het eerste deel met 3D-graphics. De gameplay heeft een grote verandering ondergaan; de speler hoeft niet langer simpelweg land te verhogen en te verlagen om grotere huizen te bouwen die zichzelf beter kunnen verdedigen. Nu moet de speler bomen omhakken om hutten te bouwen. Afhankelijk van hoeveel mannen zich in het huis bevinden, groeit de bevolking en het huis zelf sneller. Het is mogelijk om mannen op te leiden als vechters, priesters, enz. Nieuwe spreuken kunnen aan het spreukenarsenaal van de sjamaan worden toegevoegd door middel van gebed bij heiligdommen die over de wereld verspreid zijn. De meeste spreuken nemen de vorm aan van natuurrampen, zoals tornado's en vulkaanuitbarstingen.
Elk level wordt weergegeven door een kleine planeet die de speler vrij kan ronddraaien. Naast de singleplayer-campagne is het ook mogelijk om andere spelers online uit te dagen.